Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAP1L3Q99457 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms