Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms