Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms