Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms