Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms