Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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