Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHFRQ96EP1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHFRQ96EP1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms