Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms