Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms