Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL2Q969S2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEIL2Q969S2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEIL2Q969S2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEIL2Q969S2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL2Q969S2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL2Q969S2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL2Q969S2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL2Q969S2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL2Q969S2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL2Q969S2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL2Q969S2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL2Q969S2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms