Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRN2Q92932 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRN2Q92932 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms