Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms