Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHTF18Q8WVB6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTF18Q8WVB6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms