Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms