Protein–RNA interactions for Protein: Q8N402

Putative uncharacterized protein LOC388882, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N402 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N402 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N402 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N402 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N402 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N402 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N402 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N402 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N402 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N402 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N402 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N402 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N402 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N402 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N402 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N402 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms