Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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C9orf40Q8IXQ3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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C9orf40Q8IXQ3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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C9orf40Q8IXQ3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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C9orf40Q8IXQ3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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