Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
P3H3Q8IVL6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
P3H3Q8IVL6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
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