Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms