Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ALYREFQ86V81 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALYREFQ86V81 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms