Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms