Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms