Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms