Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms