Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms