Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms