Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms