Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD3Q5T2D3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms