Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP170Q5SW79 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms