Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms