Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms