Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms