Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms