Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms