Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms