Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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