Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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