Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PCSK7Q16549 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms