Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SSX1Q16384 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SSX1Q16384 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SSX1Q16384 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SSX1Q16384 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SSX1Q16384 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SSX1Q16384 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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