Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZFHX3Q15911 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms