Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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