Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms