Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
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