Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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