Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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ITGA9Q13797 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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ITGA9Q13797 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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ITGA9Q13797 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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ITGA9Q13797 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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ITGA9Q13797 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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ITGA9Q13797 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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