Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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