Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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NAE1Q13564 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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NAE1Q13564 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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NAE1Q13564 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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NAE1Q13564 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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NAE1Q13564 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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