Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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