Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CAMK2BQ13554 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms