Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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