Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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